Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms