Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZIC1Q15915 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms