Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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