Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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