Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms