Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms