Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHPRHQ149N8 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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