Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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