Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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COL9A3Q14050 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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COL9A3Q14050 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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COL9A3Q14050 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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