Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PDE6HQ13956 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PDE6HQ13956 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PDE6HQ13956 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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PDE6HQ13956 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE6HQ13956 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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