Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms