Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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TCOF1Q13428 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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TCOF1Q13428 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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TCOF1Q13428 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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TCOF1Q13428 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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TCOF1Q13428 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TCOF1Q13428 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TCOF1Q13428 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCOF1Q13428 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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