Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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RPA4Q13156 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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RPA4Q13156 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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RPA4Q13156 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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RPA4Q13156 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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