Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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NR1H3Q13133 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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NR1H3Q13133 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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