Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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CHAF1BQ13112 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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CHAF1BQ13112 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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CHAF1BQ13112 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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CHAF1BQ13112 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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