Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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MKRN3Q13064 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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MKRN3Q13064 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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MKRN3Q13064 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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MKRN3Q13064 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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MKRN3Q13064 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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