Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1P23471 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms