Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRGP23470 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRGP23470 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms