Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CRXO43186 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CRXO43186 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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