Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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