Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SCAF1Q9H7N4 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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