Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms