Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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