Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SGCBQ16585 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SGCBQ16585 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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SGCBQ16585 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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