Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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HERC1Q15751 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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HERC1Q15751 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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