Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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