Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms