| TTF1 | Q15361 | COX6CP2-201 | ENST00000444980 | 225 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | HSFY6P-201 | ENST00000445573 | 403 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | LINC01034-201 | ENST00000448806 | 277 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL445669.2-201 | ENST00000454425 | 421 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RPL5P30-201 | ENST00000465511 | 891 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | OR2A20P-203 | ENST00000498397 | 1268 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | LINC02379-201 | ENST00000505741 | 300 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC112198.3-201 | ENST00000505950 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC113346.1-201 | ENST00000510150 | 287 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | LINC00491-204 | ENST00000513815 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC008415.1-201 | ENST00000522189 | 734 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | DYNLL1P4-201 | ENST00000549314 | 266 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | LYZ-203 | ENST00000549690 | 669 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL160314.2-204 | ENST00000554730 | 380 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | PWRN1-202 | ENST00000562501 | 642 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC092378.2-202 | ENST00000569328 | 445 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC129492.2-201 | ENST00000577807 | 517 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC090616.5-202 | ENST00000582111 | 297 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC015911.9-201 | ENST00000591634 | 185 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL022161.1-201 | ENST00000604390 | 213 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL451044.1-201 | ENST00000604867 | 238 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC055876.5-201 | ENST00000605667 | 259 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL031775.1-201 | ENST00000607014 | 887 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL158063.1-201 | ENST00000615349 | 536 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC005911.1-201 | ENST00000619883 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC068831.8-201 | ENST00000620171 | 435 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC068724.3-201 | ENST00000625906 | 87 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | OR11H4-203 | ENST00000641525 | 1082 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | STXBP4-204 | ENST00000434978 | 2807 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC004803.1-201 | ENST00000503602 | 3207 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | LINC01021-204 | ENST00000512067 | 1610 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | TUG1-201 | ENST00000519077 | 5673 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RAD21-210 | ENST00000523986 | 2506 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | ZC3H11A-214 | ENST00000639812 | 11825 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | OR8G1-201 | ENST00000341493 | 936 nt | APPRIS P1 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | SNORA60-201 | ENST00000362396 | 134 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNA5SP130-201 | ENST00000364431 | 114 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNU6-343P-201 | ENST00000364709 | 104 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNU6-744P-201 | ENST00000365557 | 107 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNU6-1316P-201 | ENST00000384242 | 108 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNU11-4P-201 | ENST00000391149 | 133 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | HSPD1P16-201 | ENST00000402302 | 394 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNU4-78P-201 | ENST00000410940 | 126 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL023581.1-201 | ENST00000423500 | 455 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RPL37P21-201 | ENST00000435890 | 276 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | ZNF385D-AS2-201 | ENST00000436306 | 424 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL512271.1-201 | ENST00000439878 | 434 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | MTND1P29-201 | ENST00000448112 | 647 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RPL5P32-201 | ENST00000454085 | 879 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | OR6K1P-201 | ENST00000456766 | 971 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AP000942.1-201 | ENST00000463969 | 747 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC022795.1-201 | ENST00000473808 | 480 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC093824.1-201 | ENST00000508796 | 343 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC134698.5-201 | ENST00000519444 | 336 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | NAT2-202 | ENST00000520116 | 716 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC090092.1-201 | ENST00000530576 | 510 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC135279.1-201 | ENST00000543493 | 504 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AP002373.1-201 | ENST00000544347 | 729 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | LINC02459-201 | ENST00000551761 | 474 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC022523.3-201 | ENST00000559643 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | MIR544B-201 | ENST00000582372 | 78 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC064805.2-201 | ENST00000582959 | 523 nt | TSL 4 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC011816.2-201 | ENST00000607089 | 556 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | MIR6867-201 | ENST00000610636 | 67 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC013727.1-201 | ENST00000618581 | 839 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | MIR7154-201 | ENST00000620673 | 73 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC055839.1-201 | ENST00000634467 | 498 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | PTPN22-201 | ENST00000359785 | 3654 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | BCLAF1-214 | ENST00000531224 | 7263 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | PABPC1P9-201 | ENST00000426076 | 1612 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | ZNF117-203 | ENST00000610793 | 1374 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC006378.2-201 | ENST00000623178 | 2476 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | DMXL2-202 | ENST00000449909 | 7465 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | MS4A1-202 | ENST00000389939 | 3372 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RMDN2-204 | ENST00000406384 | 1932 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | TIPARP-207 | ENST00000542783 | 3681 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | OR5H14-202 | ENST00000641380 | 7323 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | TFPI-201 | ENST00000233156 | 3885 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | DEFB129-201 | ENST00000246105 | 698 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | TATDN1-201 | ENST00000276692 | 1018 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | NAMPT-202 | ENST00000354289 | 1213 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNY4P24-201 | ENST00000362735 | 96 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNA5SP258-201 | ENST00000362750 | 119 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL356421.1-201 | ENST00000403255 | 413 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RPL17P12-201 | ENST00000413391 | 526 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | LINC01074-201 | ENST00000422527 | 555 nt | TSL 3 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL391219.1-201 | ENST00000422570 | 483 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | ARPP21-211 | ENST00000427542 | 568 nt | TSL 4 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | DIAPH3-AS2-201 | ENST00000428656 | 367 nt | TSL 3 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | OR4C10P-201 | ENST00000434991 | 931 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | LARP1BP3-201 | ENST00000437229 | 869 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | RPL21P133-201 | ENST00000443666 | 476 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC105398.1-201 | ENST00000446073 | 402 nt | TSL 5 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | MTND4LP3-201 | ENST00000468320 | 276 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | PDCD10-214 | ENST00000487947 | 716 nt | TSL 5 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC080014.1-201 | ENST00000496877 | 1201 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC022118.1-201 | ENST00000512352 | 547 nt | TSL 5 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC092440.1-201 | ENST00000512563 | 571 nt | TSL 4 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | IGLV3-26-201 | ENST00000520756 | 302 nt | BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |
| TTF1 | Q15361 | LINC01479-202 | ENST00000546170 | 444 nt | TSL 2 BASIC | 4.99 | □□□□□ -1.61 | | |