Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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