Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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BRD3Q15059 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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BRD3Q15059 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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BRD3Q15059 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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