Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms