Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms