Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCLAFQ15004 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
PCLAFQ15004 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
PCLAFQ15004 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCLAFQ15004 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms