Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms