Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms