Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SCARF1Q14162 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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