Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms