| RUNX3 | Q13761 | SLC5A3-201 | ENST00000381151 | 11576 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4P8-201 | ENST00000514997 | 1362 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TARID-205 | ENST00000607033 | 2960 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPRC6A-202 | ENST00000368549 | 2622 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC169-203 | ENST00000379862 | 624 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U3.26-201 | ENST00000391236 | 204 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF228730.1-201 | ENST00000397972 | 663 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SFR1P1-201 | ENST00000403720 | 688 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL391417.1-201 | ENST00000404100 | 426 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136310.1-201 | ENST00000404926 | 654 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL31P52-201 | ENST00000407532 | 367 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPC5-IT1-201 | ENST00000416664 | 658 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL078590.2-202 | ENST00000422736 | 568 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z97206.2-201 | ENST00000423489 | 589 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL589935.1-218 | ENST00000434683 | 529 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P40-201 | ENST00000435209 | 294 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EEF1A1P39-201 | ENST00000440791 | 250 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P6-201 | ENST00000444896 | 598 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC239809.1-201 | ENST00000450470 | 217 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPL42P4-201 | ENST00000453267 | 443 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL080313.2-201 | ENST00000456440 | 489 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL93P-201 | ENST00000463035 | 293 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GAPDHP39-201 | ENST00000481866 | 979 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC126121.1-201 | ENST00000482313 | 553 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011037.1-201 | ENST00000483964 | 558 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS3AP50-201 | ENST00000487064 | 803 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P21-201 | ENST00000502313 | 581 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NREP-AS1-201 | ENST00000503242 | 411 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091951.3-201 | ENST00000504093 | 246 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01216-201 | ENST00000515728 | 824 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC013762.1-201 | ENST00000531136 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARHGAP28-207 | ENST00000532996 | 1859 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133372.3-201 | ENST00000553082 | 821 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC044913.1-201 | ENST00000557200 | 430 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC069029.1-201 | ENST00000558736 | 263 nt | TSL 2 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009101.2-201 | ENST00000564293 | 456 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087463.3-201 | ENST00000570105 | 415 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003009.1-201 | ENST00000571611 | 686 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007673.1-201 | ENST00000590604 | 1100 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245036.5-201 | ENST00000596330 | 847 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL360267.1-201 | ENST00000607309 | 666 nt | TSL 4 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007308.1-201 | ENST00000608856 | 373 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADARB1-213 | ENST00000611195 | 159 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022149.2-201 | ENST00000621061 | 203 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR1S1-201 | ENST00000624470 | 978 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC019226.2-201 | ENST00000625973 | 424 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC134980.1-211 | ENST00000638243 | 1094 nt | TSL 2 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02211-204 | ENST00000642024 | 1070 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC000367.1-201 | ENST00000452711 | 1766 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02070-201 | ENST00000460586 | 1321 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPIP5K2-201 | ENST00000321521 | 15407 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DMXL1-201 | ENST00000311085 | 11072 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR12D1-207 | ENST00000514827 | 1712 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHF6-205 | ENST00000625464 | 4434 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC25A17-202 | ENST00000402844 | 2405 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026523.1-202 | ENST00000559363 | 1401 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-707P-201 | ENST00000364647 | 95 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD116.1-201 | ENST00000365628 | 92 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPRR2E-201 | ENST00000368750 | 678 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-636P-201 | ENST00000384598 | 107 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1151P-201 | ENST00000384684 | 107 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAV34-201 | ENST00000390461 | 349 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA40.2-201 | ENST00000390847 | 128 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP39-201 | ENST00000411245 | 120 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EPGN-202 | ENST00000413830 | 1196 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01717-201 | ENST00000415754 | 527 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL22P18-201 | ENST00000417197 | 377 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAALADL2-AS2-201 | ENST00000424690 | 1038 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DIAPH2-AS1-201 | ENST00000439759 | 971 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008264.1-201 | ENST00000447612 | 367 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NEGR1-IT1-201 | ENST00000453121 | 534 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP9YP25-201 | ENST00000457708 | 443 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096992.1-201 | ENST00000459808 | 709 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006445.1-201 | ENST00000491925 | 405 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068305.1-201 | ENST00000497406 | 726 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC113347.4-201 | ENST00000506032 | 685 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEMA6A-AS2-201 | ENST00000508766 | 482 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01861-201 | ENST00000509568 | 537 nt | TSL 4 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Vault.1-201 | ENST00000516474 | 102 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068880.2-201 | ENST00000521016 | 362 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF279873.1-201 | ENST00000523393 | 313 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001318.2-201 | ENST00000533378 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009320.1-201 | ENST00000549070 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4U1P-201 | ENST00000554958 | 912 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL392023.2-202 | ENST00000555342 | 494 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CERS3-AS1-202 | ENST00000560718 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157402.2-201 | ENST00000566394 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015917.1-201 | ENST00000579654 | 510 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010127.1-205 | ENST00000595268 | 567 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451007.1-201 | ENST00000595491 | 289 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091057.2-201 | ENST00000602594 | 792 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01930-201 | ENST00000602672 | 870 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL137843.1-201 | ENST00000605078 | 385 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL592148.2-201 | ENST00000612210 | 372 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C8orf59-213 | ENST00000619594 | 859 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136964.1-201 | ENST00000622038 | 2990 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GMFB-210 | ENST00000628554 | 639 nt | TSL 4 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008703.1-201 | ENST00000637629 | 1174 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EVI5-208 | ENST00000540033 | 7436 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYYR1-AS1-201 | ENST00000357401 | 3412 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |