Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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