Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4BQ13620 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms