Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ITGB3BPQ13352 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms