Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATMQ13315 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATMQ13315 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATMQ13315 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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