Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms