Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF3Q13114 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF3Q13114 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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TRAF3Q13114 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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