Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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