Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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