Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COX10Q12887 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms