Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERFP50548 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERFP50548 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERFP50548 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms