Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRDP23468 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRDP23468 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRDP23468 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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