Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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HOXA2O43364 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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HOXA2O43364 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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HOXA2O43364 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA2O43364 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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