Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CRXO43186 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CRXO43186 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CRXO43186 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms